O SESI presta contas anuais ao Tribunal de Contas da União (TCU), desde o advento da Lei 2.613/55, que conta com o apoio da Controladoria Geral da União (CGU). Trata-se de uma das mais efetivas formas de controle, transparência e integridade.
Auditores independentes também avaliam as contas da Entidade.
O Código de Ética reúne princípios e condutas que norteiam a Instituição.